Due astronauti in missione esplorativa su un misterioso pianeta, da poco scoperto nelle vicinanze di Giove, vengono improvvisamente assaliti dal drago Ghidora, ma proprio quando per loro non sembra esservi scampo, sono tratti in salvo dagli alieni che abitano l'asteroide. Gli extraterrestri spiegano ai due piloti di non poterne più delle prepotenze di Ghidora ed avanzano una singolare proposta: non potrebbero i terrestri cedere loro per qualche tempo Rodan e Godzilla sì da scagliarli contro il terribile drago tricefalo? In cambio renderebbero partecipi gli uomini ad importanti scoperte scientifiche....